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R language

  • 2020-10-01

【R】ggplotとdendextendできれいなデンドログラムを描く!

デンドログラムって見た目のカスタマイズがすごく難しいですよね。。。R標準のplotだとダサいし、かと言ってggplot2で描こうとするとあまりにも難しいし。。。 そこで今回は見た目のカスタマイズがすごく簡単にできて、さらにggplotによる細かい調整も可能な方法を紹介します! それがggplotとd […]

  • 2023-01-22

【WGCNA】DEG解析じゃ満足できない?RでWGCNA解析 -Part3-モジュール検出

Part1では正規化などのデータの前処理、Part2ではネットワークの構築とデンドログラムの作成を行ってきました! 今回はWGCNAで最も重要なパートであるモジュール検出を行います! モジュール検出は自分で設定しなければならないパラメータが多くあり、解析者によって得られる結果が大きく異なります。です […]